Hala Cebulowa cechuje się nagromadzeniem niezwykle cennych siedlisk i gatunków roślin. Roślinność hali tworzy mozaikę zbiorowisk, w której istotna rola przypada eutroficznej młace górskiej Valeriano-Caricetum flavae, młakom niskoturzycowym Carici canescentis-Agrostietum caninae oraz łące mieczykowo-mietlicowej Gladiolo-Agrostietum deschampsietosum. Młaki rozwijają się głównie w otoczeniu wysięków wodnych, stanowiących źródliska Potoku Cebulowego − największego dopływu Sopotni Wielkiej. Za unikatowe w polskich Karpatach uznaje się występowanie na Hali Cebulowej (a także sąsiedniej Hali Miziowej) eutroficznej młaki górskiej, z udziałem czosnku syberyjskiego Allium sibiricum i niebielistki trwałej Sweertia perennis. Obydwa gatunki podlegają w Polsce ścisłej ochronie prawnej. Czosnek syberyjski jest gatunkiem zagrożonym wymieraniem (EN) w skali kraju i regionu, natomiast niebielistka trwała zagrożona wymieraniem (EN) jest w województwie śląskim. Od czosnku syberyjskiego, który występuje tu łanowo (grupowo), wywodzi się nazwę hali. Na hali Cebulowej rośnie także wiele innych rzadkich bądź chronionych gatunków roślin: pełnik alpejski Trollius altissimus, tojad mocny Aconitum firmum, złocień okrągłolistny Leucanthemum waldsteinii, tłustosz pospolity Pinguicula vulgaris.
Hala Cebulowa jest objęta ochroną jako użytek ekologiczny, znajduje się w granicach Parku Krajobrazowego Beskidu Żywieckiego oraz obszarów Natura 2000 − Specjalnego Obszaru Ochrony Siedlisk „Beskid Żywiecki” oraz Obszaru Specjalnej Ochrony Ptaków „Beskid Żywiecki”.